همانند هر روش دیگر استفاده شده جهت از بین بردن موهای زائد، استفاده از اپیلاسیون دارای معایبی است که قبل از استفاده از آن نیز باید در نظر گرفته شود. به طور معمول بروز عوارض در این روش، به حساسیت پوست و همچنین افرادی که اپیلاسیون را انجام می دهند و تجربه آنها بستگی دارد. با اپیلاسیون، همیشه احتمال بروز عوارض جانبی وجود دارد ، از جمله:
درد
قرمزی پوست
تحریک پوست
بروز جوش های زیرپوستی در ناحیه پوست
برجستگی
حساسیت به آفتاب
واکنش آلرژیک
عفونت
جای زخم
احساس سوزش و در مواردی درد
عوارض جانبی بالقوه عبارتند از:
خارش
سوختگی تیغ
فولیکولیت
این عوارض جانبی در نهایت به حساسیت فردی پوست، میزان تیز بودن تیغ و میزان خیس بودن پوست و همچنین تجربه کلی بستگی دارد.